tert-Butanol

Dieses einfache Beispiel zeigt eine verzweigte aliphatische Gruppe und die Behandlung einer tertiären Hydroxogruppe. Wenn man dieses Skelett zusammensetzt und dann EDIT / Add H's klickt, so werden alle 10 H-Atome wie üblich in eine Klasse geworfen, während das Programm schon in der einfachsten Symmetrieanalyse merkt, dass zwei verschiedene Typen von C-Atomen vorliegen. Berechnet man dann das Molekül, so erhält man in wenigen Sekunden -232.9865 hartree mit -V/T = 2.00000 und einem OH Abstand von 0.930 Angstr.
Mit PARAMETER / Make a new class wird das H-Atom der Hydroxylgruppe in eine eigene Klasse getan und mit PARAMETER / Edit a class die Protonexzentrizität zur Optimierung angekreuzt. Man erhält das Resultat der folgenden Figur:

Die Gesamtenergie wird jetzt -232.9910 hartree und der OH-Abstand 0.953 Angstr., offensichtilich ein besserer Wert als der vorhergehende. Der Energieunterschied beträgt jedoch nur 4.5 millihartree oder 2.8 kcal/Mol.
Die symmetriegerechte Zuordnung von Variablen bei Wasserstoffatomen lohnt sich somit meist nur marginal bezüglich der Energie. Bei Bindungslängen und -winkeln jedoch fast immer.